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Comandado pelo técnico Geninho e tendo em Paulo Baier seu principal jogador, o Goiás terminou o Brasileirão de 2005 em 3º lugar, sua melhor campanha na história, que o qualificou para a disputa da Taça Libertadores da América de 2006.

O jogador não chegou a disputar o torneio continental, pois se transferiu ao Palmeiras no início de 2006. No entanto, Baier e Geninho voltaram a se encontrar no Goiás em 2007, na disputa do Campeonato Brasileiro. Numa das partidas marcantes daquele ano, Baier desperdiçou um pênalti contra o Corinthians, clube contra o qual o Goiás brigava contra o rebaixamento. Ao final do campeonato, contudo, o clube goiano permaneceu na 1ª Divisão, e o Corinthians acabou rebaixado.